Hikâye üç kardeşi anlatır. Babalarının vefatı sonrası uzun yıllar farklı hayatlar yaşamış olan biraderler ilk defa bir araya gelir. Batum’dan bir otobüse binerek hep birlikte İstanbul’a doğru yola çıkarlar. Aralarında en büyükleri Necati, babası gibi duygularını kendine saklayan biridir. Ortancaları Hasan aile içi geçimsizlik sebebiyle gemici olmuştur. En küçük kardeş Mehmet ise annesi ile Almanya’ya yerleşmiş biridir. Bindikleri otobüste biraderler haricinde Türkiye’ye giden Rus uyruklu kadınlar da vardır. Kardeşler Türkiye’ye doğru yol alırken hem birbirlerini hem de kaderlerinin Türkiye’ye götürdüğü başka kültürden insanları tanımaya başlarlar. Balalayka, yol filmi formatı ile hem “karakter çalışması” anlatısıyla kardeşlerin hikayelerini işler, hem de farklı coğrafyalardan insanların iletişimine ağırlık vererek, Türkiye’yi kültürlerin buluştuğu bir coğrafya olarak markalaştırır.
